Lo siguiente es crear o editar el archivo .htaccess. sino crearlo.... y poner
ErrorDocument 400 /index.php
ErrorDocument 401 /index.php
ErrorDocument 403 /index.php
ErrorDocument 404 /index.php
o tambien pueden crear un archivo 404.php para que los usuarios y los robot lo detectaran que ya no existe lo que anda buscando..
muchos se preguntaran para que funciona para la seguridad web.. es porque es muy importante ya que da menos posibilidad en que un atacante encuentre los archivos en si sitio...